Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms