Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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