Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms