Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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GBX1Q14549 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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GBX1Q14549 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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GBX1Q14549 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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GBX1Q14549 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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GBX1Q14549 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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GBX1Q14549 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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GBX1Q14549 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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GBX1Q14549 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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GBX1Q14549 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
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GBX1Q14549 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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GBX1Q14549 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GBX1Q14549 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GBX1Q14549 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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GBX1Q14549 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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GBX1Q14549 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBX1Q14549 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBX1Q14549 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBX1Q14549 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBX1Q14549 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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GBX1Q14549 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBX1Q14549 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBX1Q14549 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBX1Q14549 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBX1Q14549 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBX1Q14549 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBX1Q14549 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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