Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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