Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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