Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SHROOM2Q13796 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
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