Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
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