Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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