Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
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ITGB3BPQ13352 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
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