Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXI1Q12951 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXI1Q12951 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms