Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FOXF2Q12947 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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