Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF2Q12933 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF2Q12933 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF2Q12933 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF2Q12933 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF2Q12933 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF2Q12933 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF2Q12933 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF2Q12933 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF2Q12933 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF2Q12933 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF2Q12933 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF2Q12933 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF2Q12933 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF2Q12933 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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