Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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