Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYCNQ0VAF6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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