Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 PEA2YER149C 1263 nt3.61□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 RSM27YGR215W 333 nt3.61□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 PPT2YPL148C 522 nt3.61□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 CUP9YPL177C 921 nt3.61□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 YPR027CYPR027C 834 nt3.61□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 PCI8YIL071C 1335 nt3.61□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 ORC1YML065W 2745 nt3.61□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 VIP1YLR410W 3441 nt3.6□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 ENA2YDR039C 3276 nt3.6□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 ENA1YDR040C 3276 nt3.6□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 snR70snR70 164 nt3.6□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 SPT2YER161C 1002 nt3.6□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 YGR053CYGR053C 852 nt3.6□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt3.6□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 SFH1YLR321C 1281 nt3.6□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 BET5YML077W 480 nt3.6□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 snR11snR11 258 nt3.6□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 YOR296WYOR296W 3870 nt3.6□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 ITT1YML068W 1395 nt3.6□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 GUK1YDR454C 564 nt3.59□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt3.59□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 COX6YHR051W 447 nt3.59□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 PCD1YLR151C 1023 nt3.59□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 DIM1YPL266W 957 nt3.59□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 YPL276WYPL276W 438 nt3.59□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 VPS9YML097C 1356 nt3.59□□□□□ -1.83
CTI6Q08923 TOP1YOL006C 2310 nt3.59□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 YDL180WYDL180W 1644 nt3.59□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 HEH2YDR458C 1992 nt3.58□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt3.58□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 YJR020WYJR020W 333 nt3.58□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 SMA2YML066C 1110 nt3.58□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 YBL028CYBL028C 321 nt3.58□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 snR17asnR17a 333 nt3.58□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 POL30YBR088C 777 nt3.58□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 STI1YOR027W 1770 nt3.58□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 SAG1YJR004C 1953 nt3.58□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 SEA4YBL104C 3117 nt3.57□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 DUN1YDL101C 1542 nt3.57□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 HTB1YDR224C 396 nt3.57□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 PDX1YGR193C 1233 nt3.57□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 YNR062CYNR062C 984 nt3.57□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 YOR203WYOR203W 354 nt3.57□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 KRE5YOR336W 4098 nt3.57□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 ARG2YJL071W 1725 nt3.56□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 STU1YBL034C 4542 nt3.56□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 CCM1YGR150C 2595 nt3.56□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 ATP16YDL004W 483 nt3.56□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 CLB3YDL155W 1284 nt3.56□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 HTA1YDR225W 399 nt3.56□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 GRX2YDR513W 432 nt3.56□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 NNF1YJR112W 606 nt3.56□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 IZH2YOL002C 954 nt3.56□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 SYT1YPR095C 3681 nt3.56□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 ENP2YGR145W 2124 nt3.56□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 UTP5YDR398W 1932 nt3.56□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 PSP1YDR505C 2526 nt3.55□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 YGL176CYGL176C 1665 nt3.55□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 YEL075CYEL075C 369 nt3.55□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 YIL175WYIL175W 318 nt3.55□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.55□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 RPC25YKL144C 639 nt3.55□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt3.55□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 END3YNL084C 1050 nt3.55□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 HUA2YOR284W 732 nt3.55□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 YPL088WYPL088W 1029 nt3.55□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 YLR177WYLR177W 1887 nt3.55□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 MIG2YGL209W 1149 nt3.54□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 LSM1YJL124C 519 nt3.54□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 SMD2YLR275W 333 nt3.54□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 NNT1YLR285W 786 nt3.54□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 YBL055CYBL055C 1257 nt3.54□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt3.54□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 YJR030CYJR030C 2238 nt3.54□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 VPS64YDR200C 1815 nt3.54□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 NSP1YJL041W 2472 nt3.53□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 CSR2YPR030W 3366 nt3.53□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 HRD1YOL013C 1656 nt3.53□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 TVP15YDR100W 432 nt3.53□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 CWC23YGL128C 852 nt3.53□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 GEP4YHR100C 558 nt3.53□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 PAU23YLR037C 375 nt3.53□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 YLR416CYLR416C 399 nt3.53□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.53□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 YOL107WYOL107W 1029 nt3.53□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 HHF1YBR009C 312 nt3.53□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 RPL36BYPL249C-A 303 nt3.53□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 ATP25YMR098C 1839 nt3.53□□□□□ -1.84
CTI6Q08923 FUN30YAL019W 3396 nt3.52□□□□□ -1.85
CTI6Q08923 VPS17YOR132W 1656 nt3.52□□□□□ -1.85
CTI6Q08923 REB1YBR049C 2433 nt3.52□□□□□ -1.85
CTI6Q08923 VPS33YLR396C 2076 nt3.52□□□□□ -1.85
CTI6Q08923 COG7YGL005C 840 nt3.52□□□□□ -1.85
CTI6Q08923 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3.52□□□□□ -1.85
CTI6Q08923 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3.52□□□□□ -1.85
CTI6Q08923 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.52□□□□□ -1.85
CTI6Q08923 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.52□□□□□ -1.85
CTI6Q08923 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.52□□□□□ -1.85
CTI6Q08923 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.52□□□□□ -1.85
CTI6Q08923 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt3.52□□□□□ -1.85
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