Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK1Q08629 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms