Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CXCL9Q07325 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms