Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms