Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDSPL2Q05D32 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms