Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms