Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms