Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP4Q02446 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP4Q02446 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP4Q02446 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SP4Q02446 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP4Q02446 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP4Q02446 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP4Q02446 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP4Q02446 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP4Q02446 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP4Q02446 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP4Q02446 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP4Q02446 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP4Q02446 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP4Q02446 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP4Q02446 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SP4Q02446 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SP4Q02446 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SP4Q02446 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SP4Q02446 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SP4Q02446 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SP4Q02446 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SP4Q02446 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SP4Q02446 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SP4Q02446 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SP4Q02446 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SP4Q02446 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SP4Q02446 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SP4Q02446 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SP4Q02446 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SP4Q02446 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP4Q02446 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP4Q02446 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP4Q02446 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SP4Q02446 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP4Q02446 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP4Q02446 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP4Q02446 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP4Q02446 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP4Q02446 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP4Q02446 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP4Q02446 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP4Q02446 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP4Q02446 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SP4Q02446 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP4Q02446 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP4Q02446 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP4Q02446 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP4Q02446 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP4Q02446 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP4Q02446 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP4Q02446 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP4Q02446 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SP4Q02446 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP4Q02446 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP4Q02446 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SP4Q02446 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP4Q02446 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP4Q02446 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP4Q02446 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP4Q02446 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP4Q02446 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP4Q02446 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP4Q02446 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP4Q02446 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP4Q02446 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP4Q02446 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP4Q02446 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SP4Q02446 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP4Q02446 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP4Q02446 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP4Q02446 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP4Q02446 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP4Q02446 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP4Q02446 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP4Q02446 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP4Q02446 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP4Q02446 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP4Q02446 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP4Q02446 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP4Q02446 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SP4Q02446 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SP4Q02446 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP4Q02446 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP4Q02446 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP4Q02446 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP4Q02446 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP4Q02446 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SP4Q02446 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP4Q02446 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP4Q02446 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP4Q02446 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP4Q02446 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP4Q02446 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP4Q02446 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP4Q02446 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP4Q02446 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SP4Q02446 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP4Q02446 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SP4Q02446 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms