Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
XPCQ01831 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
XPCQ01831 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
XPCQ01831 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
XPCQ01831 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
XPCQ01831 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
XPCQ01831 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
XPCQ01831 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
XPCQ01831 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
XPCQ01831 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
XPCQ01831 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
XPCQ01831 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
XPCQ01831 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
XPCQ01831 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
XPCQ01831 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
XPCQ01831 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
XPCQ01831 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
XPCQ01831 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
XPCQ01831 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
XPCQ01831 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
XPCQ01831 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
XPCQ01831 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
XPCQ01831 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
XPCQ01831 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
XPCQ01831 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
XPCQ01831 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
XPCQ01831 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
XPCQ01831 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
XPCQ01831 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
XPCQ01831 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
XPCQ01831 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
XPCQ01831 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
XPCQ01831 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
XPCQ01831 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
XPCQ01831 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
XPCQ01831 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
XPCQ01831 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
XPCQ01831 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
XPCQ01831 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
XPCQ01831 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
XPCQ01831 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
XPCQ01831 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
XPCQ01831 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
XPCQ01831 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
XPCQ01831 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
XPCQ01831 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
XPCQ01831 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
XPCQ01831 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
XPCQ01831 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
XPCQ01831 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
XPCQ01831 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
XPCQ01831 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
XPCQ01831 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
XPCQ01831 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
XPCQ01831 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
XPCQ01831 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
XPCQ01831 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
XPCQ01831 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
XPCQ01831 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
XPCQ01831 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
XPCQ01831 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
XPCQ01831 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
XPCQ01831 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
XPCQ01831 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
XPCQ01831 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
XPCQ01831 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
XPCQ01831 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
XPCQ01831 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
XPCQ01831 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
XPCQ01831 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
XPCQ01831 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
XPCQ01831 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
XPCQ01831 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
XPCQ01831 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
XPCQ01831 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
XPCQ01831 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
XPCQ01831 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
XPCQ01831 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XPCQ01831 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XPCQ01831 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XPCQ01831 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XPCQ01831 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XPCQ01831 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
XPCQ01831 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XPCQ01831 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
XPCQ01831 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
XPCQ01831 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XPCQ01831 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XPCQ01831 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XPCQ01831 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
XPCQ01831 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
XPCQ01831 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
XPCQ01831 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
XPCQ01831 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
XPCQ01831 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
XPCQ01831 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
XPCQ01831 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
XPCQ01831 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
XPCQ01831 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
XPCQ01831 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms