Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms