Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms