Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL7P80098 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL7P80098 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL7P80098 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL7P80098 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL7P80098 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL7P80098 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL7P80098 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL7P80098 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL7P80098 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL7P80098 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL7P80098 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL7P80098 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL7P80098 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL7P80098 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL7P80098 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL7P80098 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL7P80098 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL7P80098 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL7P80098 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL7P80098 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL7P80098 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL7P80098 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL7P80098 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL7P80098 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL7P80098 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL7P80098 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL7P80098 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL7P80098 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL7P80098 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL7P80098 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL7P80098 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL7P80098 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL7P80098 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL7P80098 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL7P80098 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL7P80098 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL7P80098 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL7P80098 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL7P80098 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL7P80098 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL7P80098 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL7P80098 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL7P80098 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL7P80098 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL7P80098 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL7P80098 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL7P80098 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL7P80098 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL7P80098 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL7P80098 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL7P80098 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL7P80098 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL7P80098 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL7P80098 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL7P80098 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL7P80098 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL7P80098 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL7P80098 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL7P80098 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL7P80098 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL7P80098 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL7P80098 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL7P80098 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL7P80098 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL7P80098 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL7P80098 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL7P80098 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL7P80098 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL7P80098 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL7P80098 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL7P80098 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL7P80098 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL7P80098 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL7P80098 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL7P80098 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL7P80098 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL7P80098 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL7P80098 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms