Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms