Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCCD1P59942 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms