Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF10P55107 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF10P55107 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF10P55107 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF10P55107 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF10P55107 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF10P55107 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF10P55107 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF10P55107 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF10P55107 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF10P55107 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF10P55107 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF10P55107 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF10P55107 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF10P55107 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF10P55107 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF10P55107 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF10P55107 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF10P55107 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF10P55107 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF10P55107 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF10P55107 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF10P55107 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF10P55107 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF10P55107 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF10P55107 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF10P55107 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF10P55107 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF10P55107 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF10P55107 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF10P55107 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF10P55107 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF10P55107 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF10P55107 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF10P55107 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF10P55107 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF10P55107 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF10P55107 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF10P55107 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF10P55107 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF10P55107 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF10P55107 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF10P55107 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF10P55107 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF10P55107 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF10P55107 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF10P55107 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF10P55107 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF10P55107 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF10P55107 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF10P55107 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF10P55107 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF10P55107 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF10P55107 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF10P55107 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF10P55107 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF10P55107 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF10P55107 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF10P55107 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF10P55107 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF10P55107 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF10P55107 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF10P55107 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF10P55107 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF10P55107 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF10P55107 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF10P55107 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF10P55107 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF10P55107 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF10P55107 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF10P55107 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF10P55107 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF10P55107 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF10P55107 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF10P55107 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF10P55107 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF10P55107 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF10P55107 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF10P55107 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GDF10P55107 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms