Protein–RNA interactions for Protein: P53437

RRN9, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN9, yeastyeast

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN9P53437 PHO81YGR233C 3537 nt2.94□□□□□ -1.94
RRN9P53437 BUD4YJR092W 4344 nt2.94□□□□□ -1.94
RRN9P53437 CHS2YBR038W 2892 nt2.94□□□□□ -1.94
RRN9P53437 KAP104YBR017C 2757 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 APC5YOR249C 2058 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 RPL1BYGL135W 654 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 DOG2YHR043C 741 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 COX6YHR051W 447 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 IME1YJR094C 1083 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 AIM25YJR100C 984 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 AIM26YKL037W 357 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 TEM1YML064C 738 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 RPB8YOR224C 441 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 BTS1YPL069C 1008 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 RPL1AYPL220W 654 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 DPB3YBR278W 606 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 VIP1YLR410W 3441 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 ARO1YDR127W 4767 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 PCI8YIL071C 1335 nt2.93□□□□□ -1.94
RRN9P53437 SAG1YJR004C 1953 nt2.92□□□□□ -1.94
RRN9P53437 HFD1YMR110C 1599 nt2.92□□□□□ -1.94
RRN9P53437 YDL050CYDL050C 372 nt2.92□□□□□ -1.94
RRN9P53437 GUK1YDR454C 564 nt2.92□□□□□ -1.94
RRN9P53437 VMA8YEL051W 771 nt2.92□□□□□ -1.94
RRN9P53437 COBQ0105 1158 nt2.92□□□□□ -1.94
RRN9P53437 COG7YGL005C 840 nt2.92□□□□□ -1.94
RRN9P53437 MIG2YGL209W 1149 nt2.92□□□□□ -1.94
RRN9P53437 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt2.92□□□□□ -1.94
RRN9P53437 MCA1YOR197W 1299 nt2.92□□□□□ -1.94
RRN9P53437 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.92□□□□□ -1.94
RRN9P53437 YBR300CYBR300C 498 nt2.92□□□□□ -1.94
RRN9P53437 MPS1YDL028C 2295 nt2.92□□□□□ -1.94
RRN9P53437 VBA4YDR119W 2307 nt2.92□□□□□ -1.94
RRN9P53437 YGL176CYGL176C 1665 nt2.92□□□□□ -1.94
RRN9P53437 DNM1YLL001W 2274 nt2.91□□□□□ -1.94
RRN9P53437 TVP15YDR100W 432 nt2.91□□□□□ -1.94
RRN9P53437 MFA1YDR461W 111 nt2.91□□□□□ -1.94
RRN9P53437 MAM1YER106W 909 nt2.91□□□□□ -1.94
RRN9P53437 SEC4YFL005W 648 nt2.91□□□□□ -1.94
RRN9P53437 SMX2YFL017W-A 234 nt2.91□□□□□ -1.94
RRN9P53437 YIL175WYIL175W 318 nt2.91□□□□□ -1.94
RRN9P53437 YJL175WYJL175W 513 nt2.91□□□□□ -1.94
RRN9P53437 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.91□□□□□ -1.94
RRN9P53437 PHD1YKL043W 1101 nt2.91□□□□□ -1.94
RRN9P53437 MBR1YKL093W 1020 nt2.91□□□□□ -1.94
RRN9P53437 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.91□□□□□ -1.94
RRN9P53437 IMP4YNL075W 873 nt2.91□□□□□ -1.94
RRN9P53437 TSR4YOL022C 1227 nt2.91□□□□□ -1.94
RRN9P53437 IPP1YBR011C 864 nt2.91□□□□□ -1.94
RRN9P53437 YPR027CYPR027C 834 nt2.91□□□□□ -1.94
RRN9P53437 YAT2YER024W 2772 nt2.91□□□□□ -1.94
RRN9P53437 UBP8YMR223W 1416 nt2.91□□□□□ -1.94
RRN9P53437 UTP5YDR398W 1932 nt2.91□□□□□ -1.94
RRN9P53437 VAS1YGR094W 3315 nt2.91□□□□□ -1.94
RRN9P53437 CIN1YOR349W 3045 nt2.9□□□□□ -1.94
RRN9P53437 PIG2YIL045W 1617 nt2.9□□□□□ -1.94
RRN9P53437 FLO1YAR050W 4614 nt2.9□□□□□ -1.94
RRN9P53437 CWC23YGL128C 852 nt2.9□□□□□ -1.95
RRN9P53437 UPF3YGR072W 1164 nt2.9□□□□□ -1.95
RRN9P53437 RSM27YGR215W 333 nt2.9□□□□□ -1.95
RRN9P53437 PAU13YHL046C 363 nt2.9□□□□□ -1.95
RRN9P53437 GPX1YKL026C 504 nt2.9□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.9□□□□□ -1.95
RRN9P53437 MSH2YOL090W 2895 nt2.9□□□□□ -1.95
RRN9P53437 MYO5YMR109W 3660 nt2.89□□□□□ -1.95
RRN9P53437 CCT7YJL111W 1653 nt2.89□□□□□ -1.95
RRN9P53437 SYO1YDL063C 1863 nt2.89□□□□□ -1.95
RRN9P53437 HTB1YDR224C 396 nt2.89□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YPR1YDR368W 939 nt2.89□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YFH7YFR007W 1062 nt2.89□□□□□ -1.95
RRN9P53437 CTK2YJL006C 972 nt2.89□□□□□ -1.95
RRN9P53437 VMA5YKL080W 1179 nt2.89□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.89□□□□□ -1.95
RRN9P53437 SSN8YNL025C 972 nt2.89□□□□□ -1.95
RRN9P53437 TUM1YOR251C 915 nt2.89□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YBR259WYBR259W 2067 nt2.89□□□□□ -1.95
RRN9P53437 DRS2YAL026C 4068 nt2.89□□□□□ -1.95
RRN9P53437 DUF1YOL087C 3351 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 LRG1YDL240W 3054 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 AKR1YDR264C 2295 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YPD1YDL235C 504 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 BMH2YDR099W 822 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 FMN1YDR236C 657 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 NKP1YDR383C 717 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.88□□□□□ -1.95
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