Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THOP1P52888 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
THOP1P52888 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THOP1P52888 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
THOP1P52888 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THOP1P52888 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THOP1P52888 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THOP1P52888 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THOP1P52888 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
THOP1P52888 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THOP1P52888 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THOP1P52888 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
THOP1P52888 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THOP1P52888 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THOP1P52888 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
THOP1P52888 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THOP1P52888 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THOP1P52888 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THOP1P52888 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THOP1P52888 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THOP1P52888 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THOP1P52888 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THOP1P52888 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
THOP1P52888 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
THOP1P52888 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
THOP1P52888 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THOP1P52888 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
THOP1P52888 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
THOP1P52888 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
THOP1P52888 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
THOP1P52888 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THOP1P52888 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THOP1P52888 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THOP1P52888 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THOP1P52888 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THOP1P52888 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THOP1P52888 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
THOP1P52888 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
THOP1P52888 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
THOP1P52888 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THOP1P52888 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THOP1P52888 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THOP1P52888 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THOP1P52888 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
THOP1P52888 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
THOP1P52888 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
THOP1P52888 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
THOP1P52888 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
THOP1P52888 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
THOP1P52888 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
THOP1P52888 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
THOP1P52888 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
THOP1P52888 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
THOP1P52888 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
THOP1P52888 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
THOP1P52888 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THOP1P52888 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
THOP1P52888 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
THOP1P52888 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THOP1P52888 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THOP1P52888 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THOP1P52888 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THOP1P52888 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
THOP1P52888 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
THOP1P52888 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THOP1P52888 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THOP1P52888 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
THOP1P52888 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THOP1P52888 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THOP1P52888 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THOP1P52888 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THOP1P52888 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
THOP1P52888 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
THOP1P52888 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THOP1P52888 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THOP1P52888 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
THOP1P52888 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
THOP1P52888 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THOP1P52888 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
THOP1P52888 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THOP1P52888 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THOP1P52888 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THOP1P52888 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THOP1P52888 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
THOP1P52888 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
THOP1P52888 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
THOP1P52888 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THOP1P52888 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THOP1P52888 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
THOP1P52888 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THOP1P52888 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THOP1P52888 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THOP1P52888 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THOP1P52888 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THOP1P52888 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THOP1P52888 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THOP1P52888 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
THOP1P52888 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
THOP1P52888 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
THOP1P52888 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms