Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC3P51654 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC3P51654 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC3P51654 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC3P51654 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC3P51654 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC3P51654 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC3P51654 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC3P51654 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC3P51654 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC3P51654 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC3P51654 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC3P51654 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC3P51654 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC3P51654 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC3P51654 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC3P51654 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC3P51654 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC3P51654 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC3P51654 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC3P51654 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC3P51654 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC3P51654 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC3P51654 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC3P51654 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC3P51654 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC3P51654 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC3P51654 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC3P51654 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC3P51654 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC3P51654 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC3P51654 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC3P51654 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC3P51654 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC3P51654 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC3P51654 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC3P51654 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC3P51654 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC3P51654 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC3P51654 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC3P51654 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC3P51654 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC3P51654 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPC3P51654 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPC3P51654 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPC3P51654 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPC3P51654 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPC3P51654 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC3P51654 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC3P51654 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC3P51654 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC3P51654 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC3P51654 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC3P51654 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC3P51654 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC3P51654 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC3P51654 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC3P51654 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC3P51654 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC3P51654 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC3P51654 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC3P51654 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC3P51654 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC3P51654 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC3P51654 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC3P51654 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC3P51654 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC3P51654 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC3P51654 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC3P51654 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC3P51654 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC3P51654 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC3P51654 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC3P51654 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC3P51654 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC3P51654 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC3P51654 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms