Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AMPHP49418 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
AMPHP49418 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
AMPHP49418 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AMPHP49418 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AMPHP49418 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AMPHP49418 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AMPHP49418 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
AMPHP49418 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AMPHP49418 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AMPHP49418 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AMPHP49418 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AMPHP49418 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AMPHP49418 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AMPHP49418 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AMPHP49418 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AMPHP49418 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AMPHP49418 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AMPHP49418 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AMPHP49418 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AMPHP49418 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
AMPHP49418 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AMPHP49418 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AMPHP49418 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AMPHP49418 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AMPHP49418 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AMPHP49418 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AMPHP49418 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AMPHP49418 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
AMPHP49418 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AMPHP49418 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AMPHP49418 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AMPHP49418 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
AMPHP49418 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AMPHP49418 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
AMPHP49418 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AMPHP49418 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AMPHP49418 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AMPHP49418 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AMPHP49418 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AMPHP49418 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AMPHP49418 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AMPHP49418 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AMPHP49418 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AMPHP49418 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
AMPHP49418 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AMPHP49418 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AMPHP49418 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AMPHP49418 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AMPHP49418 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AMPHP49418 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AMPHP49418 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AMPHP49418 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AMPHP49418 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AMPHP49418 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AMPHP49418 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AMPHP49418 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AMPHP49418 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AMPHP49418 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
AMPHP49418 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AMPHP49418 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AMPHP49418 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
AMPHP49418 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AMPHP49418 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AMPHP49418 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AMPHP49418 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AMPHP49418 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AMPHP49418 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
AMPHP49418 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AMPHP49418 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AMPHP49418 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AMPHP49418 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
AMPHP49418 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AMPHP49418 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AMPHP49418 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AMPHP49418 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
AMPHP49418 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AMPHP49418 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AMPHP49418 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AMPHP49418 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AMPHP49418 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AMPHP49418 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
AMPHP49418 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AMPHP49418 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AMPHP49418 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
AMPHP49418 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AMPHP49418 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AMPHP49418 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AMPHP49418 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AMPHP49418 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AMPHP49418 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AMPHP49418 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AMPHP49418 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AMPHP49418 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AMPHP49418 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AMPHP49418 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AMPHP49418 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AMPHP49418 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AMPHP49418 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AMPHP49418 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms