Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
UTRNP46939 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UTRNP46939 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UTRNP46939 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UTRNP46939 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UTRNP46939 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UTRNP46939 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UTRNP46939 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UTRNP46939 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
UTRNP46939 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UTRNP46939 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UTRNP46939 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UTRNP46939 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UTRNP46939 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UTRNP46939 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UTRNP46939 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UTRNP46939 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UTRNP46939 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UTRNP46939 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UTRNP46939 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UTRNP46939 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UTRNP46939 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UTRNP46939 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UTRNP46939 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UTRNP46939 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UTRNP46939 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UTRNP46939 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UTRNP46939 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
UTRNP46939 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UTRNP46939 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UTRNP46939 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UTRNP46939 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UTRNP46939 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
UTRNP46939 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UTRNP46939 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UTRNP46939 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UTRNP46939 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UTRNP46939 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
UTRNP46939 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
UTRNP46939 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UTRNP46939 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UTRNP46939 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UTRNP46939 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UTRNP46939 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UTRNP46939 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UTRNP46939 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UTRNP46939 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UTRNP46939 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UTRNP46939 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UTRNP46939 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
UTRNP46939 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UTRNP46939 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UTRNP46939 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
UTRNP46939 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UTRNP46939 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UTRNP46939 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UTRNP46939 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UTRNP46939 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UTRNP46939 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UTRNP46939 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UTRNP46939 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UTRNP46939 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UTRNP46939 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UTRNP46939 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UTRNP46939 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UTRNP46939 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UTRNP46939 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UTRNP46939 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UTRNP46939 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UTRNP46939 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UTRNP46939 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UTRNP46939 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UTRNP46939 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UTRNP46939 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UTRNP46939 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UTRNP46939 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UTRNP46939 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UTRNP46939 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UTRNP46939 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UTRNP46939 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UTRNP46939 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UTRNP46939 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UTRNP46939 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
UTRNP46939 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UTRNP46939 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UTRNP46939 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UTRNP46939 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UTRNP46939 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UTRNP46939 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UTRNP46939 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UTRNP46939 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UTRNP46939 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UTRNP46939 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
UTRNP46939 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UTRNP46939 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UTRNP46939 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
UTRNP46939 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UTRNP46939 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
UTRNP46939 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UTRNP46939 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms