Protein–RNA interactions for Protein: P40005

GIM4, Prefoldin subunit 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIM4P40005 MRP10YDL045W-A 288 nt2.34□□□□□ -2.03
GIM4P40005 PAU14YIL176C 363 nt2.34□□□□□ -2.03
GIM4P40005 ASG7YJL170C 630 nt2.34□□□□□ -2.03
GIM4P40005 PAU1YJL223C 363 nt2.34□□□□□ -2.03
GIM4P40005 YBL108WYBL108W 306 nt2.34□□□□□ -2.03
GIM4P40005 FIR1YER032W 2631 nt2.34□□□□□ -2.04
GIM4P40005 YKR078WYKR078W 1758 nt2.33□□□□□ -2.04
GIM4P40005 DUG2YBR281C 2637 nt2.33□□□□□ -2.04
GIM4P40005 MRD1YPR112C 2664 nt2.33□□□□□ -2.04
GIM4P40005 RPB9YGL070C 369 nt2.33□□□□□ -2.04
GIM4P40005 OTU2YHL013C 924 nt2.33□□□□□ -2.04
GIM4P40005 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.33□□□□□ -2.04
GIM4P40005 TTI2YJR136C 1266 nt2.33□□□□□ -2.04
GIM4P40005 END3YNL084C 1050 nt2.33□□□□□ -2.04
GIM4P40005 YNR062CYNR062C 984 nt2.33□□□□□ -2.04
GIM4P40005 THI80YOR143C 960 nt2.33□□□□□ -2.04
GIM4P40005 TMN3YER113C 2121 nt2.33□□□□□ -2.04
GIM4P40005 NUP170YBL079W 4509 nt2.33□□□□□ -2.04
GIM4P40005 PHO91YNR013C 2685 nt2.33□□□□□ -2.04
GIM4P40005 SEC59YMR013C 1560 nt2.32□□□□□ -2.04
GIM4P40005 PIN4YBL051C 2007 nt2.32□□□□□ -2.04
GIM4P40005 AI2Q0055 2565 nt2.32□□□□□ -2.04
GIM4P40005 SCP160YJL080C 3669 nt2.32□□□□□ -2.04
GIM4P40005 YRB1YDR002W 606 nt2.32□□□□□ -2.04
GIM4P40005 YOS1YER074W-A 258 nt2.32□□□□□ -2.04
GIM4P40005 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.32□□□□□ -2.04
GIM4P40005 YGR026WYGR026W 837 nt2.32□□□□□ -2.04
GIM4P40005 DCG1YIR030C 735 nt2.32□□□□□ -2.04
GIM4P40005 KTI11YBL071W-A 249 nt2.32□□□□□ -2.04
GIM4P40005 SWD3YBR175W 948 nt2.32□□□□□ -2.04
GIM4P40005 RDS2YPL133C 1341 nt2.32□□□□□ -2.04
GIM4P40005 COG2YGR120C 789 nt2.31□□□□□ -2.04
GIM4P40005 SPO16YHR153C 597 nt2.31□□□□□ -2.04
GIM4P40005 YKL177WYKL177W 339 nt2.31□□□□□ -2.04
GIM4P40005 YOR062CYOR062C 807 nt2.31□□□□□ -2.04
GIM4P40005 RPS11BYBR048W 471 nt2.31□□□□□ -2.04
GIM4P40005 YNL011CYNL011C 1335 nt2.31□□□□□ -2.04
GIM4P40005 KEL2YGR238C 2649 nt2.31□□□□□ -2.04
GIM4P40005 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.3□□□□□ -2.04
GIM4P40005 YFH1YDL120W 525 nt2.3□□□□□ -2.04
GIM4P40005 PSY1YKL076C 384 nt2.3□□□□□ -2.04
GIM4P40005 RSA3YLR221C 663 nt2.3□□□□□ -2.04
GIM4P40005 TMA10YLR327C 261 nt2.3□□□□□ -2.04
GIM4P40005 COS1YNL336W 1146 nt2.3□□□□□ -2.04
GIM4P40005 CNS1YBR155W 1158 nt2.3□□□□□ -2.04
GIM4P40005 OSW7YFR039C 1533 nt2.3□□□□□ -2.04
GIM4P40005 MSB1YOR188W 3414 nt2.29□□□□□ -2.04
GIM4P40005 SCD5YOR329C 2619 nt2.29□□□□□ -2.04
GIM4P40005 YCR064CYCR064C 411 nt2.29□□□□□ -2.04
GIM4P40005 PTI1YGR156W 1278 nt2.29□□□□□ -2.04
GIM4P40005 ERV41YML067C 1059 nt2.29□□□□□ -2.04
GIM4P40005 RRG8YPR116W 834 nt2.29□□□□□ -2.04
GIM4P40005 TOF1YNL273W 3717 nt2.29□□□□□ -2.04
GIM4P40005 IRA2YOL081W 9240 nt2.28□□□□□ -2.04
GIM4P40005 STE11YLR362W 2154 nt2.28□□□□□ -2.04
GIM4P40005 NFI1YOR156C 2181 nt2.28□□□□□ -2.04
GIM4P40005 MST27YGL051W 705 nt2.28□□□□□ -2.04
GIM4P40005 YGR039WYGR039W 312 nt2.28□□□□□ -2.04
GIM4P40005 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.28□□□□□ -2.04
GIM4P40005 MST28YAR033W 705 nt2.28□□□□□ -2.04
GIM4P40005 snR11snR11 258 nt2.28□□□□□ -2.04
GIM4P40005 YOR387CYOR387C 621 nt2.28□□□□□ -2.04
GIM4P40005 YPL071CYPL071C 471 nt2.28□□□□□ -2.04
GIM4P40005 APL5YPL195W 2799 nt2.27□□□□□ -2.05
GIM4P40005 KHA1YJL094C 2622 nt2.27□□□□□ -2.05
GIM4P40005 ARF1YDL192W 546 nt2.27□□□□□ -2.05
GIM4P40005 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt2.27□□□□□ -2.05
GIM4P40005 YOL057WYOL057W 2136 nt2.27□□□□□ -2.05
GIM4P40005 ENP2YGR145W 2124 nt2.26□□□□□ -2.05
GIM4P40005 YPK1YKL126W 2043 nt2.26□□□□□ -2.05
GIM4P40005 YCL076WYCL076W 744 nt2.26□□□□□ -2.05
GIM4P40005 PET191YJR034W 327 nt2.26□□□□□ -2.05
GIM4P40005 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.26□□□□□ -2.05
GIM4P40005 YMR187CYMR187C 1296 nt2.26□□□□□ -2.05
GIM4P40005 JID1YPR061C 906 nt2.26□□□□□ -2.05
GIM4P40005 SMC6YLR383W 3345 nt2.26□□□□□ -2.05
GIM4P40005 SKO1YNL167C 1944 nt2.26□□□□□ -2.05
GIM4P40005 YBT1YLL048C 4986 nt2.26□□□□□ -2.05
GIM4P40005 NEL1YHR035W 1893 nt2.26□□□□□ -2.05
GIM4P40005 YDL199CYDL199C 2064 nt2.26□□□□□ -2.05
GIM4P40005 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.25□□□□□ -2.05
GIM4P40005 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.25□□□□□ -2.05
GIM4P40005 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.25□□□□□ -2.05
GIM4P40005 YCL019WYCL019W 5313 nt2.25□□□□□ -2.05
GIM4P40005 ERV1YGR029W 570 nt2.25□□□□□ -2.05
GIM4P40005 SOL3YHR163W 750 nt2.25□□□□□ -2.05
GIM4P40005 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.25□□□□□ -2.05
GIM4P40005 AYR1YIL124W 894 nt2.25□□□□□ -2.05
GIM4P40005 TRM112YNR046W 408 nt2.25□□□□□ -2.05
GIM4P40005 RFC5YBR087W 1065 nt2.25□□□□□ -2.05
GIM4P40005 YBR209WYBR209W 318 nt2.25□□□□□ -2.05
GIM4P40005 DAD3YBR233W-A 285 nt2.25□□□□□ -2.05
GIM4P40005 DUN1YDL101C 1542 nt2.25□□□□□ -2.05
GIM4P40005 SPF1YEL031W 3648 nt2.24□□□□□ -2.05
GIM4P40005 RGA1YOR127W 3024 nt2.24□□□□□ -2.05
GIM4P40005 SWA2YDR320C 2007 nt2.24□□□□□ -2.05
GIM4P40005 APC11YDL008W 498 nt2.24□□□□□ -2.05
GIM4P40005 RSM24YDR175C 960 nt2.24□□□□□ -2.05
GIM4P40005 YKR070WYKR070W 1059 nt2.24□□□□□ -2.05
GIM4P40005 COQ10YOL008W 624 nt2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.8 ms