Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upk2P38575 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upk2P38575 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk2P38575 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk2P38575 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms