Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJA4P35212 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA4P35212 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA4P35212 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA4P35212 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA4P35212 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA4P35212 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA4P35212 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA4P35212 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA4P35212 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA4P35212 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA4P35212 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA4P35212 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA4P35212 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA4P35212 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA4P35212 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA4P35212 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA4P35212 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA4P35212 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA4P35212 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA4P35212 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA4P35212 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA4P35212 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA4P35212 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA4P35212 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA4P35212 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA4P35212 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA4P35212 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA4P35212 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA4P35212 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA4P35212 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA4P35212 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA4P35212 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA4P35212 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA4P35212 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA4P35212 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA4P35212 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA4P35212 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA4P35212 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA4P35212 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA4P35212 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA4P35212 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA4P35212 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA4P35212 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA4P35212 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA4P35212 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA4P35212 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA4P35212 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA4P35212 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA4P35212 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA4P35212 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA4P35212 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA4P35212 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA4P35212 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA4P35212 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA4P35212 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA4P35212 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA4P35212 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA4P35212 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA4P35212 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA4P35212 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA4P35212 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA4P35212 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA4P35212 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA4P35212 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA4P35212 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA4P35212 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA4P35212 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA4P35212 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA4P35212 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA4P35212 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA4P35212 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA4P35212 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA4P35212 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA4P35212 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA4P35212 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA4P35212 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA4P35212 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA4P35212 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA4P35212 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA4P35212 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA4P35212 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA4P35212 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA4P35212 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA4P35212 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA4P35212 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA4P35212 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA4P35212 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA4P35212 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA4P35212 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA4P35212 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA4P35212 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA4P35212 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA4P35212 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA4P35212 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA4P35212 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA4P35212 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GJA4P35212 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GJA4P35212 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA4P35212 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms