Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms