Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP2P32456 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP2P32456 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP2P32456 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP2P32456 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP2P32456 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP2P32456 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GBP2P32456 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GBP2P32456 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP2P32456 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP2P32456 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP2P32456 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP2P32456 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP2P32456 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP2P32456 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP2P32456 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP2P32456 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP2P32456 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP2P32456 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP2P32456 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP2P32456 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP2P32456 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP2P32456 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP2P32456 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP2P32456 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP2P32456 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP2P32456 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP2P32456 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP2P32456 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP2P32456 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP2P32456 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP2P32456 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP2P32456 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP2P32456 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP2P32456 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP2P32456 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP2P32456 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP2P32456 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP2P32456 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP2P32456 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP2P32456 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP2P32456 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP2P32456 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP2P32456 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP2P32456 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP2P32456 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP2P32456 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP2P32456 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP2P32456 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP2P32456 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP2P32456 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP2P32456 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP2P32456 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP2P32456 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP2P32456 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP2P32456 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP2P32456 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP2P32456 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP2P32456 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP2P32456 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP2P32456 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP2P32456 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP2P32456 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP2P32456 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP2P32456 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP2P32456 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP2P32456 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP2P32456 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP2P32456 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP2P32456 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP2P32456 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP2P32456 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP2P32456 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP2P32456 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP2P32456 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP2P32456 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP2P32456 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP2P32456 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP2P32456 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP2P32456 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP2P32456 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP2P32456 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP2P32456 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP2P32456 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP2P32456 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP2P32456 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP2P32456 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP2P32456 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP2P32456 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP2P32456 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP2P32456 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP2P32456 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP2P32456 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP2P32456 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP2P32456 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP2P32456 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP2P32456 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP2P32456 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP2P32456 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP2P32456 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms