Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms