Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TM4SF1P30408 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 563.2 ms