Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms