Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
YY1P25490 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
YY1P25490 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
YY1P25490 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
YY1P25490 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
YY1P25490 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
YY1P25490 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
YY1P25490 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YY1P25490 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YY1P25490 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
YY1P25490 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YY1P25490 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YY1P25490 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
YY1P25490 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YY1P25490 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YY1P25490 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YY1P25490 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YY1P25490 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YY1P25490 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YY1P25490 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YY1P25490 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YY1P25490 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YY1P25490 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YY1P25490 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YY1P25490 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YY1P25490 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YY1P25490 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YY1P25490 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YY1P25490 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YY1P25490 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YY1P25490 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YY1P25490 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YY1P25490 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YY1P25490 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YY1P25490 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YY1P25490 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YY1P25490 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YY1P25490 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YY1P25490 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YY1P25490 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
YY1P25490 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
YY1P25490 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
YY1P25490 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YY1P25490 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YY1P25490 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YY1P25490 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YY1P25490 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YY1P25490 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YY1P25490 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YY1P25490 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YY1P25490 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
YY1P25490 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YY1P25490 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YY1P25490 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YY1P25490 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
YY1P25490 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YY1P25490 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YY1P25490 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YY1P25490 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YY1P25490 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YY1P25490 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YY1P25490 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YY1P25490 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YY1P25490 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YY1P25490 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YY1P25490 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YY1P25490 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YY1P25490 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YY1P25490 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
YY1P25490 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YY1P25490 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
YY1P25490 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YY1P25490 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YY1P25490 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YY1P25490 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YY1P25490 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
YY1P25490 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
YY1P25490 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
YY1P25490 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YY1P25490 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YY1P25490 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YY1P25490 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
YY1P25490 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YY1P25490 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YY1P25490 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YY1P25490 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YY1P25490 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YY1P25490 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YY1P25490 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YY1P25490 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YY1P25490 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YY1P25490 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YY1P25490 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YY1P25490 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YY1P25490 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
YY1P25490 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YY1P25490 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YY1P25490 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YY1P25490 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YY1P25490 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms