Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATF3P18847 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATF3P18847 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATF3P18847 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ATF3P18847 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATF3P18847 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATF3P18847 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATF3P18847 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATF3P18847 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATF3P18847 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATF3P18847 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATF3P18847 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATF3P18847 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATF3P18847 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATF3P18847 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATF3P18847 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ATF3P18847 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATF3P18847 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATF3P18847 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATF3P18847 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATF3P18847 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATF3P18847 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATF3P18847 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF3P18847 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF3P18847 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF3P18847 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF3P18847 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF3P18847 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF3P18847 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF3P18847 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF3P18847 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF3P18847 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF3P18847 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF3P18847 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF3P18847 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF3P18847 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF3P18847 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF3P18847 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF3P18847 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATF3P18847 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATF3P18847 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATF3P18847 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATF3P18847 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF3P18847 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF3P18847 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF3P18847 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF3P18847 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF3P18847 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF3P18847 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF3P18847 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF3P18847 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF3P18847 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF3P18847 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF3P18847 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF3P18847 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF3P18847 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATF3P18847 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATF3P18847 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATF3P18847 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATF3P18847 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATF3P18847 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ATF3P18847 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATF3P18847 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF3P18847 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF3P18847 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF3P18847 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF3P18847 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF3P18847 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF3P18847 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF3P18847 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF3P18847 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF3P18847 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF3P18847 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF3P18847 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF3P18847 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF3P18847 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF3P18847 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF3P18847 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF3P18847 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF3P18847 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF3P18847 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF3P18847 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF3P18847 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF3P18847 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF3P18847 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF3P18847 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF3P18847 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF3P18847 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF3P18847 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF3P18847 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF3P18847 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF3P18847 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF3P18847 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF3P18847 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF3P18847 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF3P18847 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF3P18847 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF3P18847 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF3P18847 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF3P18847 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms