Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CFTRP13569 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
CFTRP13569 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
CFTRP13569 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CFTRP13569 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
CFTRP13569 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CFTRP13569 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CFTRP13569 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CFTRP13569 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
CFTRP13569 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CFTRP13569 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CFTRP13569 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CFTRP13569 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CFTRP13569 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CFTRP13569 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CFTRP13569 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CFTRP13569 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CFTRP13569 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CFTRP13569 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CFTRP13569 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CFTRP13569 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CFTRP13569 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
CFTRP13569 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CFTRP13569 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CFTRP13569 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CFTRP13569 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CFTRP13569 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CFTRP13569 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
CFTRP13569 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CFTRP13569 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CFTRP13569 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CFTRP13569 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CFTRP13569 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CFTRP13569 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CFTRP13569 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CFTRP13569 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CFTRP13569 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CFTRP13569 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CFTRP13569 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CFTRP13569 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CFTRP13569 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CFTRP13569 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
CFTRP13569 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CFTRP13569 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CFTRP13569 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CFTRP13569 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CFTRP13569 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CFTRP13569 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CFTRP13569 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CFTRP13569 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CFTRP13569 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CFTRP13569 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
CFTRP13569 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CFTRP13569 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CFTRP13569 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CFTRP13569 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CFTRP13569 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CFTRP13569 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.46
CFTRP13569 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CFTRP13569 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CFTRP13569 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CFTRP13569 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CFTRP13569 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CFTRP13569 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CFTRP13569 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CFTRP13569 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CFTRP13569 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CFTRP13569 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CFTRP13569 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CFTRP13569 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CFTRP13569 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CFTRP13569 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CFTRP13569 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CFTRP13569 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CFTRP13569 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CFTRP13569 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CFTRP13569 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CFTRP13569 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CFTRP13569 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CFTRP13569 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CFTRP13569 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CFTRP13569 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CFTRP13569 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CFTRP13569 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CFTRP13569 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CFTRP13569 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CFTRP13569 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CFTRP13569 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CFTRP13569 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CFTRP13569 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CFTRP13569 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CFTRP13569 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CFTRP13569 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CFTRP13569 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CFTRP13569 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CFTRP13569 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CFTRP13569 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CFTRP13569 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CFTRP13569 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CFTRP13569 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms