Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIP12755 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIP12755 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIP12755 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIP12755 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIP12755 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIP12755 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIP12755 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIP12755 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIP12755 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIP12755 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIP12755 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIP12755 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIP12755 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIP12755 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIP12755 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIP12755 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIP12755 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIP12755 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIP12755 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIP12755 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIP12755 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIP12755 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIP12755 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIP12755 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIP12755 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIP12755 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIP12755 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIP12755 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIP12755 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIP12755 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIP12755 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIP12755 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIP12755 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIP12755 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIP12755 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIP12755 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIP12755 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIP12755 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIP12755 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIP12755 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIP12755 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIP12755 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIP12755 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIP12755 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIP12755 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIP12755 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIP12755 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIP12755 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIP12755 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIP12755 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIP12755 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIP12755 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIP12755 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIP12755 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIP12755 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIP12755 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIP12755 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIP12755 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIP12755 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIP12755 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIP12755 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIP12755 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIP12755 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIP12755 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIP12755 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIP12755 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIP12755 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIP12755 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIP12755 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIP12755 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIP12755 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIP12755 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIP12755 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIP12755 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIP12755 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIP12755 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIP12755 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIP12755 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIP12755 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIP12755 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIP12755 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIP12755 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIP12755 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIP12755 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIP12755 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIP12755 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIP12755 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIP12755 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIP12755 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIP12755 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIP12755 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIP12755 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIP12755 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIP12755 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIP12755 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKIP12755 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKIP12755 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKIP12755 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKIP12755 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms