Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKBP12277 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKBP12277 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKBP12277 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKBP12277 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKBP12277 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKBP12277 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKBP12277 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKBP12277 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKBP12277 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKBP12277 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKBP12277 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKBP12277 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKBP12277 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKBP12277 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKBP12277 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKBP12277 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CKBP12277 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CKBP12277 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKBP12277 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKBP12277 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKBP12277 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKBP12277 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CKBP12277 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKBP12277 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKBP12277 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKBP12277 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKBP12277 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKBP12277 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CKBP12277 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKBP12277 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKBP12277 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKBP12277 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKBP12277 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKBP12277 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKBP12277 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CKBP12277 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKBP12277 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKBP12277 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKBP12277 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKBP12277 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKBP12277 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKBP12277 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKBP12277 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKBP12277 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKBP12277 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKBP12277 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKBP12277 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKBP12277 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKBP12277 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CKBP12277 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKBP12277 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKBP12277 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKBP12277 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKBP12277 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKBP12277 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKBP12277 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKBP12277 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CKBP12277 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CKBP12277 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CKBP12277 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CKBP12277 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKBP12277 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKBP12277 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKBP12277 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKBP12277 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKBP12277 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKBP12277 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CKBP12277 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKBP12277 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKBP12277 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKBP12277 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKBP12277 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKBP12277 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKBP12277 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKBP12277 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKBP12277 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKBP12277 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKBP12277 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKBP12277 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKBP12277 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKBP12277 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKBP12277 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKBP12277 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKBP12277 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKBP12277 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKBP12277 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CKBP12277 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKBP12277 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CKBP12277 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CKBP12277 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKBP12277 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKBP12277 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKBP12277 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKBP12277 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKBP12277 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKBP12277 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKBP12277 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKBP12277 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CKBP12277 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms