Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODC1P11926 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODC1P11926 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODC1P11926 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODC1P11926 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODC1P11926 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODC1P11926 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODC1P11926 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODC1P11926 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODC1P11926 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODC1P11926 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODC1P11926 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODC1P11926 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODC1P11926 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODC1P11926 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODC1P11926 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODC1P11926 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODC1P11926 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ODC1P11926 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ODC1P11926 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODC1P11926 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODC1P11926 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODC1P11926 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODC1P11926 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODC1P11926 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODC1P11926 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODC1P11926 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODC1P11926 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODC1P11926 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODC1P11926 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODC1P11926 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ODC1P11926 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ODC1P11926 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODC1P11926 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ODC1P11926 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODC1P11926 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODC1P11926 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ODC1P11926 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ODC1P11926 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ODC1P11926 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ODC1P11926 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ODC1P11926 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ODC1P11926 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ODC1P11926 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ODC1P11926 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ODC1P11926 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ODC1P11926 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ODC1P11926 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODC1P11926 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODC1P11926 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODC1P11926 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODC1P11926 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODC1P11926 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODC1P11926 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ODC1P11926 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODC1P11926 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODC1P11926 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODC1P11926 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODC1P11926 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODC1P11926 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODC1P11926 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODC1P11926 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODC1P11926 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODC1P11926 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODC1P11926 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODC1P11926 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODC1P11926 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODC1P11926 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODC1P11926 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODC1P11926 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODC1P11926 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODC1P11926 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODC1P11926 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODC1P11926 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODC1P11926 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ODC1P11926 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODC1P11926 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODC1P11926 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODC1P11926 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODC1P11926 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms