Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HKR1P10072 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HKR1P10072 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HKR1P10072 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HKR1P10072 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HKR1P10072 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HKR1P10072 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HKR1P10072 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HKR1P10072 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HKR1P10072 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HKR1P10072 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HKR1P10072 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HKR1P10072 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HKR1P10072 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HKR1P10072 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HKR1P10072 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HKR1P10072 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HKR1P10072 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HKR1P10072 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HKR1P10072 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HKR1P10072 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HKR1P10072 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HKR1P10072 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HKR1P10072 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HKR1P10072 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HKR1P10072 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HKR1P10072 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HKR1P10072 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HKR1P10072 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HKR1P10072 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HKR1P10072 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HKR1P10072 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HKR1P10072 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HKR1P10072 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HKR1P10072 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HKR1P10072 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HKR1P10072 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HKR1P10072 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HKR1P10072 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HKR1P10072 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HKR1P10072 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HKR1P10072 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HKR1P10072 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HKR1P10072 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HKR1P10072 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HKR1P10072 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HKR1P10072 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HKR1P10072 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HKR1P10072 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HKR1P10072 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HKR1P10072 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HKR1P10072 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HKR1P10072 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HKR1P10072 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HKR1P10072 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HKR1P10072 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HKR1P10072 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HKR1P10072 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HKR1P10072 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HKR1P10072 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HKR1P10072 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HKR1P10072 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HKR1P10072 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HKR1P10072 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HKR1P10072 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms